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A Rede Amostral de Monitoramento da balneabilidade no estado atualmente é composta por 133 pontos, distribuídos em toda a costa baiana. As amostras de água para analises da balneabilidade são coletadas sistematicamente semanalmente, no período da manhã em locais com maior concentração de banhista.
De acordo com a resolução Conama a praia é considerada imprópria quando mais de 20% das amostras coletadas em cinco semanas consecutivas, apresentar resultado superior a 1.000 coliformes fecais ou 800 Escherichia coli, ou quando, na última coleta, o resultado for superior a 2500 coliformes termotolerantes ou 2000 Escherichia coli ou 400 enterococos por 100 mL de água.
No período em que o tempo estiver chuvoso, as praias podem ser contaminadas por arraste de detritos diversos, carregados das ruas através das galerias pluviais, podendo causar doenças. Além disso, é desaconselhável, ainda em dias de sol, o banho próximo à saída de esgotos, desembocadura dos rios urbanos, córregos e canais de drenagem.
Salvador
Praias impróprias: Tubarão (Em frente ao conjunto habitacional, próximo à antiga fábrica de cimento), Periperi (Na saída de acesso à praia após travessia da via férrea), Ondina (Situada próximo ao Morro da Sereia em frente ao Ed. Maria José), Armação (Em frente ao Hotel Alah Mar e a Rua João Mendes da Costa), Boca do Rio (Em frente ao posto Salva Vidas) e Patamares (Em frente ao posto Salva Vidas Patamares, próximo ao Coliseu do Forró e ao Caranguejo de Sergipe).
Baía de Todos os Santos
Praias impróprias: Cabuçu (Em frente as barracas), Mutá (Em frente à ponte de mutá, no lado esquerdo), Cações (Próximo à Escola Ruy Barbosa, e a Igreja Nossa Senhora Coração de Jesus) e Gameleira (Em frente a Cruz da Gameleira).
Costa dos Coqueiros
Praias impróprias: Rio Itibituba (Acesso pela BA 099 após Polícia Rodoviária).
Costa do Dendê
Praias impróprias: Não há irregularidades nas praias.
Costa do Cacau
Praias impróprias: Concha (Em frente as barracas de praia, próximo ao desembocadura do rio de Contas) e Sul (Em frente as barracas, acesso Km 0, em direção ao Aeroporto de Ilhéus).
Costa do Descobrimento
Praias impróprias: Não há irregularidades nas praias.
Costa das Baleias
Praias impróprias: Alcobaça (Em frente ao Quiosque Cabana da Ilha).